品种是影响奶业发展的核心因素,在奶牛育种中全面应用基因组选择技术,可以实现青年公牛早期准确选择,从而大幅度缩短世代间隔,加快群体遗传进展。同时,增加目标性状功能基因 SNP 分子遗传标记可以进一步提高基因组选择的准确性。
近日,我所所奶牛研究室联合中国农业大学动物科技学院在国际期刊MDPI Genes在线发表了题为“Identification of Genetic Effects of ACADVL and IRF6 Genes with Milk Production Traits of Holstein Cattle in China”的研究论文。该研究基于不同生理阶段奶牛肝脏组织的转录组测序结果,通过生物信息学和基因功能富集分析,结合DNA混池PCR产物直接测序方法,鉴定出ACADVL基因和IRF6基因为产奶性状候选功能基因,并检测到ACADVL基因和IRF6基因的16个SNP位点。在河北地区中国荷斯坦母牛1186头群体中进行个体基因型检测和多态位点与产奶性状关联分析结果表明,两个基因中鉴定到的16个SNPs均与产奶性状达到显著或极显著关联,并且SNP位点间高度连锁形成的单倍型块也与产奶性状达到显著关联,可以作为遗传标记用于奶牛基因组选择。
我所奶牛研究室彭朋为第一作者,王昆研究员和中国农业大学动物科技学院孙东晓教授为该论文的共同通讯作者。该论文得到河北省重点研发计划(22326321D)、河北省农林科学院科技创新专项(2022KJCXZX-LYS-19)、国家重点研发计划项目(2021YFF1000700)等项目资助。